Angela Re

• Le attività sono riassumibili in: A. Sviluppo di tecniche di modellazione per lo studio della regolazione post-trascrizionale dell'espressione genica mediata da specifiche classi di proteine. B. Tecniche statistiche inferenziali per l'identificazione di molecole bloccanti la traduzione mitocondriale con elevato potenziale terapeutico in particolari tumori, in particolare il glioblastoma. C. Metodi formali orientati all'individuazione di alterazioni del DNA coinvolte nella genesi dei tumori. D. Analisi di sequenze biologiche per identificare peptidi segnale coinvolti nella terminazione non convenzionale della traduzione proteica, che sono stati utilizzati per caratterizzare il meccanismo di degradazione di polipeptidi destinati a raggiungere il reticolo endoplasmatico. E. Sviluppo di metodi per la rappresentazione coordinata, l'organizzazione e l'analisi integrata di dati sperimentali multilivello e altamente processuali, compreso lo sviluppo di nuovi approcci per l'individuazione di strutture modulari e l'analisi differenziale di reti biologiche. F. Metanalisi di dati relativi all’espressione genica (trascrizionali, traduzionali) per studiare il controllo post-trascrizionale nella determinazione dell’abbondanza proteica. L’applicazione di diversi approcci statistici ha portato allo sviluppo di un modello di sostanziale disaccoppiamento tra la variazione dell’abbondanza dei trascritti e la variazione del livello di caricamento nell’apparato traduzionale. G. Sviluppo di una banca dati scientifica per l’identificazione degli elementi regolatori a livello post-trascrizionale, che ha conseguito un ampio riconoscimento nella comunità scientifica. H. Analisi integrata di dati di espressione genica multi-livello (profili del numero di copie di DNA su scala genomica e profili trascrittomici) per l’identificazione di reti di interazione deregolati in specifiche forme tumorali.
• Research activities are developed along two main lines introduced here: A. Data-driven representations of the biomolecular space through the development of databases, annotation and prediction tools. B. Computational microbiology applied to prokaryotic organisms and ecosystems declined in different application contexts.

ERC sectors

SDG

• Collegio di Ingegneria Gestionale e della Produzione. Componente

PhD

• Biotecnologie per la sostenibilità nella produzione chimica. A.A. 2024/25, MATERIALI, PROCESSI SOSTENIBILI E SISTEMI PER LA TRANSIZIONE ENERGETICA. Main teacher

Bachelor of Science

• Fondamenti di fisica. A.A. 2024/25, TECNOLOGIE PER L'INDUSTRIA MANIFATTURIERA. Titolare del corso
• Fondamenti di fisica. A.A. 2023/24, TECNOLOGIE PER L'INDUSTRIA MANIFATTURIERA. Titolare del corso
• Fondamenti di fisica. A.A. 2022/23, TECNOLOGIE PER L'INDUSTRIA MANIFATTURIERA. Titolare del corso

- PhD

Biotechnology for sustainability in chemical production. A.Y. 2024/25, MATERIALS, SUSTAINABLE PROCESSES AND SYSTEMS FOR THE ENERGY TRANSITION.

- First degree course

Fundamentals of Physics. A.Y. 2024/25, TECHNOLOGIES FOR THE MANUFACTURING INDUSTRY.

• Institute of Fundamental Physics and Materials for Nanotechnology (DISAT)

Projects funded by competitive calls

• PROT-mBIOMA-AD - A computational pipeline for the analysis of the role of proteins from unknown species in shotgun metagenomics data: application to the study of gut microbiota in a mouse model of Alzheimer's disease., (2023-2025) - Responsabile Scientifico
  PNRR – Mission 4
• NEST - Spoke 3 - NEST - Network 4 Energy Sustainable Transition - Spoke 3, (2022-2025) - Componente gruppo di Ricerca
  PNRR – Mission 4

Projects funded by commercial contracts

• Contratto di ricerca (TECHNICAL SERVICES AGREEMENT) tra il Politecnico (DISAT) e Solvay Specialty Polymers Italy S.p.A. per la realizzazione del Progetto di Ricerca “Development of PVDF-based polymeric membranes applied as a solid-state electrolyte separator in the lithium battery sector” , (periodo sconosciuto) - Componente gruppo di Ricerca
  Commercial Research

• Giulia Usai. Programme in Ingegneria Chimica (36^th cycle, 2020-2024)
  Thesis: Green Chemicals via Photosynthetic Microbial Factories: Integrating Metabolic and Bioprocess Engineering for 2-Phenylethanol Production and CO2 Valorization
• Luca Ricci. Programme in Ingegneria Chimica (35^th cycle, 2019-2023)
  Thesis: Microbial valorization of C1 waste gases for 2,3-butanediol production: a single and a double stage approach

• Ricci, Luca; Cen, Xuecong; Zu, Yuexuan; Antonicelli, Giacomo; Chen, Zhen; Fino, Debora; ... (2025)
  Metabolic Engineering of E. coli for Enhanced Diols Production from Acetate. In: ACS SYNTHETIC BIOLOGY, vol. 14, pp. 1204-1219. ISSN 2161-5063
  Contributo su Rivista
• Favero, Francesco; Re, Angela; Dason, Mohammed Salim; Gravina, Teresa; Gagliardi, Maria; ... (2024)
  Characterization of gut microbiota dynamics in an Alzheimer’s disease mouse model through clade-specific marker-based analysis of shotgun metagenomic data. In: BIOLOGY DIRECT, vol. 19, pp. 1-16. ISSN 1745-6150
  Contributo su Rivista
• Cocchi, Simona; Greco, Valentina; Sidarovich, Viktoryia; Vigna, Jacopo; Broso, ... (2024)
  EGCG Disrupts the LIN28B/Let-7 Interaction and Reduces Neuroblastoma Aggressiveness. In: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, vol. 25, pp. 1-21. ISSN 1422-0067
  Contributo su Rivista
• Usai, G; Cordara, A; Mazzocchi, E; Re, Angela; Fino, D; Pirri, Cf; Menin, B (2024)
  Coupling dairy wastewaters for nutritional balancing and water recycling: sustainable heterologous 2-phenylethanol production by engineered cyanobacteria. In: FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, vol. 12, pp. 01-18. ISSN 2296-4185
  Contributo su Rivista
• Politano, Gianfranco; Benso, Alfredo; Rehman, Hafeez Ur; Re, Angela (2024)
  PRONTO-TK: a user-friendly PROtein Neural neTwOrk tool-kit for accessible protein function prediction. In: NAR GENOMICS AND BIOINFORMATICS, vol. 6. ISSN 2631-9268
  Contributo su Rivista