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SORGENTE - SORveglianza GENomica in PiemonTE: sequenziamento di massa e analisi filogenomica di SARS CoV-2 e altri virus a carattere pandemico mediante metodi innovativi, automatici, a basso costo e alta efficienza
Duration:
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Abstract
Per il controllo della pandemia da virus SARS-CoV-2 si impone lo studio del virus e delle sue varianti attraverso lo sviluppo di modelli innovativi di sorveglianza che, partendo da tecnologie di sequenziamento e analisi filogenetiche, possano essere applicati su larga scala per il monitoraggio della variabilità genetica del virus e per fornire in tempi rapidi l’analisi della circolazione del virus in rapporto a diversi contesti geografici e sociali. Tale Sorveglianza Genomica (SG) è disegnata per integrare in maniera efficace ed efficiente gli strumenti di sorveglianza tradizionali, che si fondano sull’analisi epidemiologica, il campionamento sistematico di contesti a rischio, come i focolai, e approfondimenti locali per il tracciamento e l’identificazione. Si istituisce un nuovo modello di sorveglianza genomica applicabile ai virus a carattere pandemico, e si sviluppano metodi bioinformatici ad elevata efficienza per l’analisi dei dati generati tramite COVseq, al fine di applicarla su larga scala per il sequenziamento e il monitoraggio del genoma di SARS-CoV-2 e delle varianti e di integrare il sistema di sorveglianza con gli aspetti genomici e virologici applicati su tutto il territorio della Regione Piemonte.
People involved
- Mauro Gasparini (Principal Investigator)
- Debora Fino (Responsabile Scientifico di Struttura)
Structures
Partners
- ASL CITTA' DI TORINO
- Fondazione del Piemonte per l'Oncologia
- MOLTOSENSO S.R.L.
- POLITECNICO DI TORINO - AMMINISTRAZIONE CENTRALE - Coordinator
Keywords
ERC sectors
Budget
| Total cost: | € 693,354.28 |
|---|---|
| Total contribution: | € 554,683.42 |
| PoliTo total cost: | € 372,137.50 |
| PoliTo contribution: | € 297,710.00 |